Il 18 agosto un gruppo dell'ORI-OSS, il servizio segreto americano, guidato dal sergente Ferruccio Trombetti di Minerbio, viene paracadutato al di qua delle linee tedesche a Selva di Puianello, sull'Appennino modenese.

La missione, denominata Appomatox, è nata dall'iniziativa di due ufficiali dell'OSS (la futura CIA) nella sede romana del Partito comunista.

Il suo scopo è controllare i movimenti delle truppe tedesche, informare su obiettivi militari e inoltre trasmettere messaggi tra le direzioni di Roma e Milano del Partito comunista e tra il CUMER, il CLN emiliano e il CLNAI.

Nel complesso trasmetterà e riceverà circa 500 messaggi via radio. I contatti col CUMER saranno diretti solo dal dicembre 1944. Tramite essa si effettueranno numerosi lanci di armi e materiale bellico a varie formazioni partigiane.

Altre missioni alleate, americane dell'ORI-OSS o inglesi della N. 1 Special Force, avranno difficoltà nel rapporto con il Comando unico, mentre troveranno maggiore collaborazione con brigate quali la Modena di Armando e la 28a di Bulow.

La missione Santini (Victory 1 e Victory 2), guidata da Ennio Tassinari e destinata ad accompagnare la discesa della Divisione Modena verso Bologna, avrà contatti solo indiretti con il CUMER tramite ufficiali di collegamento. Lo stesso sarà per la missione inglese Wilcockson, presente a Bologna nell'ottobre 1944.

Il relativo isolamento del CUMER nei confronti delle brigate stanziate in Appennino e delle missioni di collegamento con i comandi alleati, produrrà incertezze e incomprensioni sullo svolgimento delle operazioni militari dei partigiani durante l'attacco alla Gotica e nell'imminenza della liberazione della città.

Nel febbraio 1945 il comandante del CUMER Barontini e il vice comandante Cavazzuti stabiliranno contatti diretti con la missione Sihaka, guidata dal “Capitano Bilancia” (Ferruccio Mazzara) per conto dello Stato Maggiore dell'Esercito italiano e collegata al comando britannico N.1 Special Force.

Interruzioni e contrattempi - ad esempio i ripetuti trasferimenti della base radio, tra via Saffi, via d'Azeglio e via Belle Arti - renderanno comunque i rapporti precari e insicuri nei momenti di massima urgenza, alla vigilia dell'attuazione del piano insurrezionale.