Pochi giorni prima della guerra contro l'Austria, a Bologna comincia un vero e proprio rastrellamento contro i cattolici ostili al nuovo stato italiano, benchè da tempo essi abbiano annunciato la sospensione di ogni attività di propaganda e di diffusione della stampa "sovversiva".

Minacce, arresti, perquisizioni sono provocate dalla legge Crispi del 17 maggio, la cosiddetta “legge dei sospetti”, che assegna al governo “poteri eccezionali per provvedere alla sicurezza interna dello Stato” e consente l'assegnazione del domicilio coatto a persone considerate sospette.

L'Associazione cattolica per la libertà della Chiesa è costretta a sciogliersi. Il fondatore Giambattista Casoni (1830-1919) riesce a fuggire in Vaticano ed entra a far parte della redazione dell'"Osservatore Romano". Il presidente Fangarezzi, arrestato e rilasciato dopo alcuni giorni, si rifugia in Svizzera.

Oltre a numerosi esponenti del laicato cattolico vergono arrestati - e spesso allontanati da Bologna - 50 sacerdoti diocesani, tra i quali 33 parroci. La cacciata dei parroci segna uno dei momenti più alti della contrapposizione tra l'autorità statale e la chiesa bolognese.