Il monastero del Corpus Domini viene sospeso per il numero sempre più ridotto delle monache di clausura che lo abitano. Sono rimaste infatti solo in quattro a perpetuare la vita religiosa avviata più di cinquecento anni fa da Caterina de' Vigri.

Nel 1456 “la Santa” venne da Ferrara per fondare il convento di via Tagliapietre secondo la regola di Santa Chiara approvata da papa Innocenzo IV e di esso fu badessa fino alla morte nel 1463.

Era una donna colta, intelligente, scriveva sermoni e suonava la violetta. A quindici giorni dalla morte il suo corpo fu trovato intatto, segno di santità, e fu deciso di conservarlo protetto in una teca, alla vista dei fedeli

Il convento, tra i più grandi d'Europa, venne occupato durante l'epoca napoleonica. Sloggiato dalle monache clarisse che lo abitavano divenne una caserma, destinazione in gran parte rimasta anche dopo che nel 1816 il cardinale arcivescovo Oppizzoni ammise di nuovo la congregazione religiosa.

La chiesa fu tra le più martoriate dai bombardamenti della seconda guerra mondiale. Fortunatamente la sacra reliquia non venne distrutta. La fede dei bolognesi nei confronti di Santa Caterina, compatrona della città, consentì il ripristino.