Con decreto del 2 luglio 2002 il Presidente della Repubblica Carlo Azeglio Ciampi (1920-2016) riconosce all'antica comunità di Medicina il titolo di città. 

Il 6 dicembre una lapide a ricordo verrà murata all'ingresso della Sala del Consiglio comunale.

Lo stemma è ora sormontato da una corona aurea con cinque torri, simbolo di Città e non più da una corona argentea a forma di castello, simbolo di Comune.

Nel 2004 verrà istituito il riconoscimento “Città di Medicina – Città di Scienza”, per celebrare i cittadini medicinesi che si sono distinti in ambito scientifico. Tra i premiati Gino Zanardi, Clarbruno Vedruccio, Giangi Poli e Marcello Ceccarelli, fondatore del Radiotelescopio di Medicina.

Il 26 giugno 2008 verrà conferita al Comune di Medicina la Medaglia d’Argento al merito civile con la seguente motivazione:

“I cittadini insorgevano, con l'adesione ad alcune formazioni partigiane, contro l'oppressione nazifascista, partecipando, con coraggiosa determinazione ed altissima dignità umana, alla lotta di Liberazione. Le donne, con la loro compattezza, offrirono un ammirevole contributo, non rivelando notizie sulle persone nascoste e conducendo azioni di rivendicazione sociale. La popolazione, sopportata la perdita di molti dei suoi figli migliori, dando luminoso esempio di eccezionale abnegazione, di incrollabile fermezza e spirito patriottico. 1944/1945 - Medicina. (BO)”