In attuazione delle disposizioni di protezione delle cose di interesse artistico e bibliografico, i libri rari e i cimeli della Biblioteca Universitaria sono trasportati con un autotreno a copertoni piombati e ricoverati presso la Badia di Santa Maria della Neve a Torrechiara di Langhirano, in provincia di Parma.

Nei mesi successivi arriveranno alla Badia manoscritti e libri di molte biblioteche regionali, tra le quali la biblioteca “Vittorio Putti” dell'Istituto Rizzoli e alcune edizioni rare e preziosi manoscritti dell'Archiginnasio, tra cui 34 lettere autografe di Galileo Galilei e le note di Luigi Galvani sull'elettricità .

Nell'estate del 1944, con l'avvicinarsi del fronte, un certo numero di libri del Rizzoli e dell'Universitaria rientreranno fortunosamente a Bologna. La maggior parte delle casse di volumi tipo B della Biblioteca Universitaria (non di pregio ma di grande interesse culturale) sarà riportata in sede nel luglio 1945 con l'aiuto del Comando militare alleato.