In aprile papa Pio VII restaura la Compagnia di Gesù. A Bologna i padri rientreranno ufficialmente nel 1830, dando rifugio anche a parecchi sacerdoti esuli dalla Spagna.

Riprenderanno la tradizionale attività di predicazione e di formazione tramite i collegi, ma senza gestione di parrocchie.

Non riusciranno a recuperare i numerosi e prestigiosi possessi immobiliari, alienati già dopo il 1773: soprattutto la grande chiesa di Santa Lucia, consacrata dal card. Paleotti nel 1576, i collegi dei Nobili e di San Carlo, il noviziato di Sant'Ignazio nel Borgo della Paglia, il vicino collegio Ancarano.

Alla fine del secolo i Gesuiti presenti in città saranno solo sei.