Il commissario Carlotti nomina il 22 giugno una nuova amministrazione municipale composta dai principali possidenti, che si assumono poteri prima distribuiti in varie delegazioni.

Il coinvolgimento nel potere della vecchia aristocrazia papalina è una sorta di “pegno politico” (Varni) per la nuova repubblica, ma la svolta in senso moderato scontenta quegli esponenti della piccola e media borghesia che più di altri hanno contribuito alla costruzione del nuovo ordinamento repubblicano e sono desiderosi di estendere le esperienze rivoluzionarie.

Proprio a Bologna, città che ospita il maggior numero di rifugiati politici dagli stati italiani ancora monarchici, c'è stato un recente tentativo di ricostituire la Società dei Raggi, una delle sette segrete rivoluzionarie nate nel periodo giacobino sull'esempio delle logge massoniche illuministe e fautrice di un programma di unità e indipendenza per la nazione italiana.