Il 19 giugno 1798 le monache benedettine di SS. Gervasio e Protasio vengono trasferite in San Leonardo. Il 19 agosto successivo il loro convento, risalente all'XI secolo e ricostruito nel Trecento, è destinato a sartoria militare.

La parrocchia sarà soppressa il 23 maggio 1806, ma intanto il parroco avrà trasferito le funzioni parrocchiali nella vicina chiesa di Santo Spirito.

Tranne una piccola porzione venduta a privati, il resto del convento diventerà una caserma, in funzione fino al 1901, quando i locali saranno acquistati dal Comune.

Nel 1910 nell'area sarà inaugurato il Mercato delle Erbe, edificio coperto progettato da Filippo Buriani e Arturo Carpi.